ساخت پروتئین ضدباکتری با هوش مصنوعی

یک محقق ایرانی در آمریکا به همراه همکارانش از هوش مصنوعی برای طراحی پروتئین‌های ضدباکتری استفاده کردند و سپس نمونه کوچکی از آن را ساختند تا بررسی کنند آیا در دنیای واقعی هم کار می‌کند یا خیر.

به گزارش گروه علم و فناوری باشگاه خبرنگاران دانشجویی(ایسکانیوز)؛ محققان آمریکایی یک هوش مصنوعی را موظف به ایجاد پروتئین‌هایی با خواص ضدمیکروبی کردند و دریافتند که برخی از آنها واقعا این خواص را دارند. در نتیجه می‌توان از این رویکرد برای ساخت داروهای جدید نیز استفاده کرد.

علی مدنی با کمک همکارانش در استارتاپ پروفلوئنت- که در زمینه زیست‌فناوری در کالیفرنیا فعال است- از یک هوش مصنوعی برای طراحی میلیون‌ها پروتئین جدید استفاده کرد و زمانی که نمونه کوچکی از این پروتئین‌ها را ساختند، متوجه شدند که بسیاری از آنها کار می‌کند.

این هوش مصنوعی که ProGen نام دارد، به روشی شبیه به الگوریتم‌های هوش مصنوعی کار می‌کند که می‌توانند محتوا تولید کنند. ProGen با یادگیری دستور زبان نحوه ترکیب اسیدهای آمینه برای تشکیل 280 میلیون پروتئین موجود، نحوه تولید پروتئین‌های جدید را آموخت. از این رو محققان می‌توانند به جای اینکه موضوعی را برای نوشتن محتوا به هوش مصنوعی بدهند، گروهی از پروتئین‌های مشابه را برای تمرکز روی آن مشخص کنند. در این مورد، محققان گروهی از پروتئین‌های دارای فعالیت ضد میکروبی را انتخاب کردند.

اولین ایمپلنت مغز کامپیوتر توسط یک محقق ایرانی کاشته شد

آنها بررسی‌هایی را روی فرآیند هوش مصنوعی انجام دادند تا الگوریتم‌های آن اسید آمینه «بیهوده» تولید نکند. سپس نمونه واقعی از مولکول‌های پیشنهادی هوش مصنوعی را تولید و در سلول‌های واقعی آزمایش کردند. از ۱۰۰ مولکولی که هوش مصنوعی به آنها پیشنهاد داده بود، ۶۶ مولکول در واکنش‌های شیمیایی توانستند باکتری‌های موجود در سفیده تخم‌مرغ و بزاق دهان را از بین ببرند.

محققان پنج پروتئین را که شدیدترین واکنش را داشتند انتخاب کردند و آنها را به نمونه‌ای از باکتری «اشریشیا کُلی» اضافه کردند. دو تا از این پروتئین‌ها توانستند این باکتری را از بین ببرند.

گفتنی است اشریشیا کلی یا ای‌کلی یکی از گونه‌های میکروبی است که در دستگاه گوارش پستانداران زندگی می‌کند. روده بزرگ انسان، محل زندگی بیش از ۷۰۰ گونه باکتریایی است. این باکتری‌ها فعالیت‌های زیستی مختلفی دارند که بسیاری از آنها برای موجود میزبان،‌ مفید هستند. یکی از این موارد، تولید آنزیم‌های لازم برای تجزیه و هضم مولکول‌هایی است که مهره‌داران، قادر به هضم آنها نیستند. این باکتری‌ها همچنین، مقادیر کمی از ویتامین‌ها را تولید می‌کنند که جذب خون می‌شوند. جلوگیری از رشد و تکثیر باکتری‌های سمی، مزیت دیگری است که از همزیستی با این باکتری‌ها نصیب میزبان می‌شود. این باکتری کاملا با محیط بدن انسان سازگار شده است؛ به طوری که حتی دستگاه ایمنی، که شناسایی مولکول‌های بیگانه و تخریب آنها را برعهده دارد،‌ این باکتری را «خودی» تلقی می‌کند و علیه آن تحریک نمی‌شود.

محققان می‌گویند: اگرچه توالی اسید آمینه پروتئین‌های پیشنهادی هوش مصنوعی تا ۳۰ درصد با پروتئین‌های واقعی تفاوت داشت، شکل آنها تقریبا با پروتئین‌های طبیعی مطابقت داشت.

آنها می‌افزایند: از ابتدا مشخص نبود که هوش مصنوعی بتواند توالی اسیدهای آمینه را تا این حد تغییر دهد و همچنان شکل صحیج پروتئین را حفظ کند.

مدنی می‌گوید که فرآیند مشابهی می‌تواند برای ایجاد مولکول‌های آزمایشی جدید برای توسعه دارو مورد استفاده قرار گیرد، اگرچه آنها همچنان باید در آزمایشگاه‌ها آزمایش شوند که این امر زمان‌بر است.

ساخت پروتئین ضدباکتری با هوش مصنوعی

علی مدنی دکتری‌اش را از دانشگاه کالیفرنیا در برکلی گرفته و عاشق هوش مصنوعی و زیست‌شناسی است. از این رو استارتاپی را در همین زمینه بنیانگذاری کرده و مدیرعامل آن است. این استارتاپ Profluent نام دارد. مدنی قبل از تاسیس این استارتاپ از تجربیاتش در زمینه یادگیری ماشینی استفاده کرد و پروژه‌های جالبی را با استفاده از یادگیری عمیق، مدل‌سازی زبان و بینایی کامپیوتری در شرکت سیلزفورس ریسرچ رهبری کرد. علاوه براین، معمار هوش مصنوعی ProGen بود که مدل‌سازی مولد را برای طراحی پروتئین پیش می‌برد. این شرکت در زمینه علوم زیستی و ژن درمانی پیشگام است و سعی دارد با کمک به پیشرفت درمان‌های جدید به صورت ایمن، سریع و مقرون به‌صرفه، راهکارهایی را برای افرادی ارائه دهد که هر روز با بیماری دست و پنجه نرم می‌کنند. این شرکت همچنین آنتی‌بادی و پروتئین برای دانشمندان تولید می‌کند تا بتوانند روی زیست‌فناوری و داروسازی کار کنند.

کد خبر: 1169149

برچسب‌ها

نظر شما

شما در حال پاسخ به نظر «» هستید.
  • نظرات حاوی توهین و هرگونه نسبت ناروا به اشخاص حقیقی و حقوقی منتشر نمی‌شود.
  • نظراتی که غیر از زبان فارسی یا غیر مرتبط با خبر باشد منتشر نمی‌شود.
  • 0 + 0 =